Είναι παρόμοια της κλασικής οδού. Άρχεται με τη σύνδεση της δεσμεύουσας μανόζη λεκτίνης (ΜΒΛ) στην επιφάνεια των βακτηρίων με πολυσακχαρίτες που περιέχουν μαννόζη, που συνεπάγεται την ενεργοποίηση δύο πρωτεασών σερίνης, των MASP-1 και-2, ουσιωδώς παρόμοιων με τα κλάσματα C1r και C1s της κλασικής οδού. Ο σχηματισμός MBL/MASP-1/MASP-2-τρι-μοριακού συμπλέγματος απολήγει στην ενεργοποίηση των MASPs και ακολούθως [α] στη διάσταση του C4 σε C4a (που διαλύεται στο μικροπεριβάλλον) και σε C4b (που συνδέεται με τις κυτταρικές μεμβράνες) και, [β] στη διάσταση του C2, σε C2a που συνδέεται με τις μεμβράνες, σε συνδυασμό με το C4b και σε C2b, που διαλύεται στο μικροπεριβάλλον. Το παραγόμενο σύμπλεγμα C4bC2aC3b, είναι η C5 κονβερτάση, με το σχηματισμό της οποίας περαιώνεται η οδός της λεκτίνης.